B-Indica dos tipos de estructuras secundarias e indica que tipos de enlace mantienen dicha estructura.

En la estructura secundaria podemos distinguir dos modelos básicos: Configuración alfa o helicoidal y Configuración beta o lámina plegada.

En la configuración helicoidal es la cadena, la cual se dispone como un tirabuzón estableciéndose entre vuelta y vuelta  un enlace de puente de hidrogeno para dar estabilidad y forma a la molécula.

 La configuración de lámina plegada ocurre cuando las cadenas de polipétidos se sitúan paralelamente situándose entre ellas un  enlace de puente de hidrogeno.